ノロウイルス（Norovirus） - ノロウイルス大辞典

ノロウイルスの特徴

ノロウイルスは約7,500塩基を持つ、プラス鎖の一本鎖RNAウイルスに分類されるエンベロープを持たないです。形状は、直径 30-38nm（ナノメートル）の正二十面体であり、ウイルスの中では小さい部類に属します。電子顕微鏡で見たときに、その表面にコップ状の窪んだ構造が観察されることがカリシウイルス命名の由来となりました。現在、ノロウイルスに属するウイルスはGenogroup I (GI)とGenogroup II (GII)の2つの遺伝子群に分類され、さらにそれぞれは14と17あるいはそれ以上の遺伝子型に分類されています。２０１５年の秋から２０１６年の春にかけて、今まで流行していたノロウイルスの遺伝子が突然変異し、新しい種類が流行している事を川崎市と国立感染症研究所が発表しました。今まで流行している種類に対しては、ヒトも免疫力がありますが、新しい種類は免疫力も無く大流行することもあり注意を呼び掛けています。また、各遺伝子型に対応した血清型があると考えられ、極めて多様性を持った集団として存在する。下図に構造蛋白コード領域の上流部分約250塩基の塩基配列に基づいて作成した系統樹を示した。この領域は、後述する検出用RT-PCRプライマーG1SKF & G1SKR, G2SKF & G2SKRによって増幅されるPCR増幅産物の、プライマー部分を除いた領域である。GI, GIIに含まれる遺伝子型番号は欧米の研究者らと協議の上、Fields VIROLOGYの第4版に従ってナンバリングした。ヒトに感染するノロウイルスは、実験に必要な病原体を動物で培養する事が出来ず、人体実験で培養する事も倫理的に難しく、実験室で培養させる方法が確立されない為に研究も遅れています。特徴は、寒く乾燥した環境を得意としており、乾燥した状態でも4℃では8週間程度、20℃では4週間以上感染力を失わないとされています。ノロウイルスのイメージ

RT-PCRプライマーG1SKF & G1SKR, G2SKF & G2SKRによって増幅される領域のうち、プライマーの部分を除いた253塩基をDDBJのclustalWを用いてアライメントし、Kimura 2-parameterで遺伝学的距離を算出した。分岐点検定のためブートストラップ検定は1000回行い、950以上を統計学的に有意な分岐とした。系統樹はclustalWの値に基づき、Njplotで作成した。遺伝子型別はKatayamaら（Viology 299, p225-239, 2002）の方法に基づいて行い、遺伝子型番号についてはFields VIROLOGYの第4版に従った。＊印は、VLPと免疫血清を用いたEIAで、相互に抗原性が異なることを確認済みの遺伝子型である（国立感染症研究の情報）。